Совет контрольно-счетных органов Республики Коми был создан в декабре 2010 года. Первоначально в его состав входили Контрольно-счетная палата Республики Коми (возглавила) и 4 муниципальных контрольно-счетных органа: контрольно-счетные палаты городских округов «Сыктывкар», «Ухта», «Усинск» и муниципального района «Вуктыл».
В течение 2011-2014 годов по мере создания в республике муниципальных контрольно-счетных органов в состав Совета вошли все 20 муниципальных палат и комиссий, имеющих статус юридического лица.
На 1 января 2017 года муниципальными контрольно-счетными органами заключено 124 соглашения о передаче полномочий по осуществлению внешнего финансового контроля бюджетов городских и сельских поселений, что составляет 75 % от их общего количества (165).